Министерството на земеделието и храните предложи мащабна административна реформа, която предвижда преструктуриране на ключови ведомства, съкращаване на щатни бройки и оптимизация на функциите в сектора. Промените, които са пуснати за обществено обсъждане, се очаква да влязат в сила от 1 януари 2027 г. Основен акцент в реформата е сливането на Изпълнителната агенция по горите и Изпълнителната агенция по рибарство и аквакултури в нова структура. Предвижда се числеността на администрацията в горския сектор да бъде намалена от 300 на 276 души, а в териториалните звена – от 1119 на 1096. Главна дирекция „Рибарство и аквакултури“ ще запази седалището си в Бургас и ще оперира с четири териториални звена. Промени предстоят и в лозаро-винарския сектор, където Изпълнителната агенция по лозата и виното се влива в Българската агенция по безопасност на храните (БАБХ). Към БАБХ ще бъде създадена специализирана структура, която ще поеме лозарския регистър, лабораториите в София и Пловдив, както и териториалните звена. Реформата засяга 4245 стопански обекта, включително гроздопроизводители и производители на вино и оцет. От министерството посочват, че целта е съсредоточаване на контрола в една структура. В сферата на земеделската селекция се предвижда сливане на Изпълнителната агенция по селекция и репродукция в животновъдството с агенцията по сортоизпитване. Новата структура ще носи името Изпълнителна агенция по селекция и репродукция в земеделието. Промяната засяга 56 развъдни организации и над 6000 производители и търговци на посевен и посадъчен материал. Реформата предвижда съкращения на щатни бройки в няколко структури: 120 във фонд „Земеделие“, 100 в БАБХ и 253 в Селскостопанска академия. В централното управление на Министерството на земеделието администрацията ще бъде намалена с 37 бройки (5,54%). Според мотивите към проекта, голяма част от съкращенията засягат трайно незаети позиции или служители, придобили право на пенсия. За изплащане на обезщетения при съкращенията министерството ще поиска допълнителни средства в размер на 1 216 330 евро. Предложенията срещат съпротива от страна на синдикатите и браншови организации. Още през септември те изразиха опасения пред Министерския съвет, че структурните промени крият риск от прекъсване на европейски плащания, загуба на квоти за улов и налагане на санкции от Съда на ЕС. В мотивите към проекта министерството посочва, че реформата е наложена от необходимостта да се преодолее фрагментирането на административните звена, размиването на отговорности и неоптималното разпределение на човешкия ресурс.